آزمایش مبنی بر ترانسکریپتوم آلرژی زاهای گرده برنج…
چکیده
مواد حساسیت زای موجود در گرده از فراوانترین محصولات رونویسی شده و ترجمه شده در تاریخچه زندگی گیاهان و بویژه گیاهان علفی هستند. برای شناسایی آلرژی های گوناگون گرده ایی در برنج، آلرژی زاهای مفروض در ژنوم برنج شناسایی شد و بیان آنها بااستفاده از ریزآرایه GeneChip برنج Affymetrix 57K شاخصه بندی کردند. در بین فراوانترین رونوشت های داوطلب مختص گرده می توان به Ory s 1 beta-expansin، Ory s 7 EF hand، Ory s 2، Ory s 11, Ory s 12 profilin A، Ory s 23، خانواده 28 گلیکولیز هیدرولاز (پلی گالاکتوروناز) و پروتئین های متصل FAD اشاره کرد. پروتئین های گرده که زیاد بیان شده بودند در چند عدد رونوشت به مقدار فراوان وجود داشتند و گاها با تصاویر آینه ایی واقع در مناطق نزدیک نوار مخالف DNA همراه بودند. بسیاری از این پروتئین های گرده بدون اینترون هستند و بصورت رونوشت هایی که رونوشت تقریبا یکسان عناصر تنظیمی خود را حفظ می کنند، متصل می شوند. Ory s 23 تغییر پذیری کم و تعداد زیاد رونوشت را نمایان می کند که نشانگر تقویت و افزایش ژن جدید می باشد. برخی رونوشت ها دارای ژن کاذب هستند که بواسطه فعالیت جابجایی به عقب اصل و منشأ خود را نشان میدهند؛ برخی توالی های آلرژی زای مفروض دارای محصولات ترکیبی به همراه توالی های تکرار عناصر جابجا شدنی (LTRها) می باشند. فراوانی و مقدار توالی های تکراری مجاور، فعالسازی عناصر جابجاشدنی و تولید زیاد رونوشتهای mRNA ظاهرا در یک زمان در گرده رخ می دهند و در سیندرومی که پروتئین های با نسخه برداری بالا در آن رونویسی می شوند، سهیم است و با ویژگی های دوکی شکل ترجمه مانند گروه سازی و حذف اینترون ها قرار داده می شود.
تصادفی
